اواخر سال ۱۳۹۸ در روزهایی که کشور همچون سایر نقاط جهان در تب و تاب مواجهه به ویروس کرونا بود، قرار بود در اسفندماه ۹۸ کنکور دکتری با حضور بیش از ۲۰۰ هزار داوطلب برگزار شود که ناگهان اولین بر آزمون‌های کشوری مُهر تعلیق خورد.
همزمان با آن ۷ آزمون کشوری دیگر از جمله امتحانات علوم پایه پزشکی، امتحانات علوم پایه دندانپزشکی، امتحانات پیش کارورزی، امتحانات جامع داروسازی (۱۸۰ واحدی)، آزمون جامع پیش درمانگاهی دامپزشکی و آزمون دستیاری پزشکی نیز به تعویق افتادند.
در ادامه این تعویق‌ها هر زمان یک تاریخی برای آزمون‌ها اعلام می‌شد و در مقابل داوطلبان نیز از شرایط برگزاری کنکورها در شرایط کرونا اطلاعی نداشتند و با توجه به خطر بیماری که همچنان ناشناخته بود درخواست داشتند که آزمون‌ها برگزار نشود.
همان زمان مدارس و دانشگاه‌ها تعطیل شد و قرار شد آموزش از طریق مجازی پیگیری شود و این موضوع برای داوطلبان آزمون‌ها شرایط ویژه‌ای را ایجاد کرد. ترم بهمن ماه نیمه‌کاره به آموزش مجازی کوچ کرده بود و بسیاری از سازوکارهای آموزشی دچار تغییر و تحول شده بود.
ادامه پاندمی کرونا اجازه برنامه‌ریزی را از سیستم آموزشی سلب کرده بود. در حالی که جامعه با موضوع شیوع بیماری مواجه بود و خانواده یک میلیون نفری داوطلبان کنکورهای کشوری نگران وضعیت برگزاری و چگونگی برگزاری بودند، کنکورهای کارشناسی ارشد و دکتری با مصوبه ستاد ملی مدیریت بیماری کرونا در چند نوبت به تعویق افتادند.
ابتدا مقرر شد این آزمون‌ها بعد از ماه مبارک رمضان سال ۱۳۹۹ برگزار شوند اما با ادامه شرایط خطرناک بیماری کرونا و اعتراضات گسترده داوطلبان زمان آزمون‌ها تغییر یافت و قرار شد کنکور سراسری سال ۹۹ از ۱۲ و ۱۳ تیرماه به ۳۰ و ۳۱ مردادماه ۹۹ و آزمون دکتری تخصصی سال ۹۹ که قرار بود در ۹ خرداد برگزار شود در ۲۶ تیر برگزار شود و آزمون کارشناسی ارشد سال ۹۹ نیز که پیش از این قرار بود در روزهای ۲۲ و ۲۳ خردادماه برگزار شود به روزهای ۲ و ۳ مرداد موکول شد.
اما این زمان‌ها بازهم تغییر کرد و زمان برگزاری آزمون کارشناسی ارشد ناپیوسته سال ۱۳۹۹ به ۱۶ و ۱۷ مردادماه ۹۹ و زمان آزمون دکتری تخصصی (نیمه متمرکز) سال ۹۹ به پنجشنبه ۹ مرداد سال ۹۹ موکول شد. در نهایت آزمون دکتری سال ۹۹ به عنوان اولین آزمون کشوری در دوران کرونا، با پروتکل‌های بهداشتی خاص که برای اولین بار در دوران آزمون‌های کشوری بود، برگزار شد.
